Онкологи во главе с главным исследователем д-ром Даниэлем Де Карвальо из Центра рака принцессы Маргарет объединили «жидкую биопсию», эпигенетические изменения и машинное обучение, чтобы разработать анализ крови для выявления и классификации рака на самых ранних стадиях.
Результаты, опубликованные онлайн сегодня в Nature, описывают не только способ выявления рака, но и обещают, что смогут найти его раньше, когда его легче лечить, и задолго до появления симптомов, говорит д-р Де Карвалью, старший научный сотрудник онкологического центра.
«На этом этапе мы очень рады, - говорит д-р Де Карвалью. «Основная проблема рака заключается в том, как обнаружить его на ранней стадии. Это проблема как искать иглу в стоге сена,о том, как найти в крови одну-в-миллиардную мутацию, связанную с раком, особенно на ранних стадиях, где количество опухолевой ДНК в крови минимально».
Профилируя эпигенетические изменения вместо мутаций, команда смогла идентифицировать тысячи модификаций, уникальных для каждого типа рака. Затем, используя большой подход к данным, они применили машинное обучение для создания классификаторов, способных идентифицировать присутствие ДНК, полученной из рака, в образцах крови и определить тип рака. Это в основном решает проблему когда «одна игла в стоге сена» становится «тысячами игл в стоге сена», где компьютеру просто нужно найти несколько игл, чтобы определить, в каком стоге они находятся.
Ученые отслеживали происхождение и тип рака, сравнивая 300 образцов опухоли пациентов с семи очагов заболевания (легкие, поджелудочная, кишечник, грудь, лейкемия, мочевой пузырь и почка) и образцы здоровых доноров с анализом бесклеточной ДНК, циркулирующей в крови плазмы. В каждом образце «плавающая» ДНК плазмы соответствовала опухолевой ДНК. С тех пор команда расширила исследования и теперь профилировала и успешно сопоставляла более 700 образцов опухоли и крови от большего числа типов рака.
Помимо лаборатории, следующие шаги по дальнейшему утверждению этого подхода включают анализ данных из крупных исследований в области здравоохранения, которые уже проводятся в нескольких странах, где образцы крови были собраны за несколько месяцев до начала диагностики рака. Затем подход должен быть подтвержден в проспективных исследованиях для скрининга рака.
Источник: https://medicalxpress.com/news/2018-11-approach-cancer-earlier-blood.html
Комментарии
Пока комментариев нет
Новый комментарий