Для мужчин, у которых недавно был диагностирован рак предстательной железы, или у пациентов, которые уже проходили лечение, риск метастазирования является решающим фактором при выборе дальнейшего лечения. В случае с раком простаты, а также другими типами рака, рост и распространение первичной опухоли обусловлены амплификацией или делецией частей генома, известными как изменения количества копий CNA. В новом исследовании ученые разработали новый анализ для оценки CNA, который является более дешевым, быстрым и доступным методом диагностики, по сравнению с другими диагностическими методами.
Метастазы возникают в 16% случаев рака простаты и отвечают примерно за 8% всех случаев смерти от рака у мужчин. Во время диагностики можно выявить мужчин с повышенным риском метастазирования, которые получат больше преимуществ от агрессивной терапии. Выявление CNA в ткани предстательной железы или крови может служить показателем того, прогрессировало ли ранее диагностированное заболевание. Амплифицированные или удаленные гены представляют новые мишени для лечения агрессивного рака простаты.
Новый анализ NG-CNA является таргетным методом секвенирования амплификаций, способным анализировать 902 геномных объекта, принадлежащих 194 геномным областям. По сравнению со сравнительной геномной гибридизацией(CGH), NG-CNA может обрабатывать образцы быстрее и дешевле. Например, с NG-CNA стоимость выделения ДНК, подготовки библиотек ДНК и секвенирования реагентов может составлять от 20 до 40 долларов за образец, по сравнению со 1000$ за секвенирование всего генома.
Фактически, NG-CNA обеспечивает доступ к приложениям персонализированной медицины за часть стоимости традиционных подходов к секвенированию генома.
Другое практическое преимущество NG-CNA заключается в том, что результаты легче расшифровать, по сравнению с результатами секвенирования генома. Новый анализ позволяет обрабатывать от сотен до тысяч образцов за один раз. Кроме того, NG-CNA может обрабатывать меньшее количество материала (12,5 нг), чем требуется для выполнения других методов. Это позволяет анализировать клеточные линии, хирургические образцы и образцы биопсии.
В предыдущей работе ученые разработали показатель метастатического потенциала MPS, используя данные из других измерительных техник. Они обнаружили, что MPS является предиктором рака предстательной предстательной железы, трижды-негативного рака молочной железы и метастазов аденокарциномы легкого. В текущем исследовании данные анализа NG-CNA использовались для расчета MPS в 70 образцах, полученных после хирургического вмешательства, с известными клиническими исходами, и результаты в высокой степени коррелировали с результатами анализа Oncoscan CNV. В отдельной группе была обнаружена клиническая и аналитическая достоверность между хирургическими образцами и соответствующими биопсиями, выполненными исключительно на платформе NG-CNA.
«Мы считаем, что использование анализа NG-CNA поможет улучшить персонализированную медицину путем выявления агрессивных опухолей и генетических мутаций, которые являются предикторами ответа на таргетную терапию» - сообщили ученые.
Источник: https://medicalxpress.com/news/2018-12-faster-cheaper-metastasis-prostate-cancer.html
Комментарии
Пока комментариев нет
Новый комментарий